Koku moleküllerinin tanımlanması.
International Fragrance Association (IFRA) tarafından tanımlanan 3158 koku molekülün:
1.İsim (IUPAC, SMILES, StdINCI),
2. Formül yapısı (*cdx, *.mol, *.jpg),
3. Molekül ağırlığı,
4. Yoğunluğu,
5. Kaynama noktası,
6. Buhar basıncı,
7. Hidrojen bağı yapabilecek atomlarının sayısı,
8. pH 7,4’deki dağılım katsayısı (LogD),
9. Polarlanabilirliği (dipol momenti),
10. Yüzey gerilimi,
11. Molar hacmi,
12. Nokta grubu (C1, Cs, vd.),
13. Birinci koku notası,
14. İkinci koku notası,
15. Üçüncü koku notası tarafımızdan standardize edilerek formülleri ile yüklenecektir.
Veri tabanı oluşturma işlemi esnasında yapılan işlemlerde kullanılan bilgisayar programı da tarafımızdan geliştirilmiştir.
Bu Veriler Niçin Seçildi?
İsim (IUPAC, SMILES, StdINCI) ve formül yapısı (*cdx, *.mol, *.jpg) kimyasal formülün gerekliliğidir.
İsim üç farklı şekilde alınarak hata yapılmasının önüne geçilmesi amaçlanmıştır.
Bu isimlerden faydalanılarak kimyasal formül çizilmiştir. *.cdx formatı molekül çizim formatıdır, *.mol formatı quantum hesaplamalarının yapılması (minimum enerjili hal, bağ uzunlukları, açıları vd.) için tercih edilmiştir, *.jpg ise resim formatıdır ve molekülün nasıl göründüğünü anlamak için seçilmiştir.
Molekül ağırlığı, yoğunluğu, kaynama noktası, buhar basıncı ve hidrojen bağı yapabilecek atomlarının sayısı molekülün büyüklüğü ve uçuculuğu ile ilgili parametrelerdir.
Molekül kolay buharlaşır mı, su ile nasıl etkileşir, koku reseptörlerine ulaşabilme kolaylığı nasıldır? Sorularına cevap bulmak için seçilmişlerdir.
pH 7,4’deki dağılım katsayısı (LogD), molekülün koku reseptörlerinin etrafındaki su/protein ara kesitinde ne kadar çözünebileceği ile ilişkili bir parametredir.
Polarlanabilirliği (dipol momenti), molekülün suda çözünürlüğü ile alakalı parametredir.
Yüzey gerilimi, molekülün reseptör yüzeyinde yayılıp yayılmayacağını diğer bir deyimle reseptör yüzeyine yapışıp yapışmayacağı (adezyon/kohezyon kuvvetleri) ile ilgili parametredir.
Molar hacmi, molekülün koku reseptörünün aktif merkezine girip girmeyeceğini anlamamızı sağlayan özelliğidir.
Nokta grubu (C1, Cs, vd.), molekülde simetri olup olmadığını anlamamızı sağlayan matematiksel analizdir. Koku reseptörünün anahtar-kilit modeline göre mi yoksa etkileşme sonucu uygunluk modeline göre mi çalıştığını anlamamızı sağlar.
Koku ortama eklendiğinde eğer molekül hidrofobik bir karakterli ise su ile az etkileştiği içinçabuk buharlaşır ve ilk alınan koku olur ve birinci koku notası olarak tanımlanır.
Eğer polar karakterli ise yani hidrofilik ise özelliklede hidrojen bağı yapıyorsa su tarafından tutulur ve reseptöre daha geç ulaşır ve ikinci koku notası olarak tanımlanır.
Eğer molekül polar karakterli ise ve aldehit ve ester grupları içeriyorsa reseptör etrafındaki veya insan tenindeki nemli ortamda su ve/veya oksijen ile reaksiyona girip molekül yapısını değiştirdikten sonra koku reseptörüne ulaşabilir buda, üçüncü koku notası olarak tanımlanır.
Notalar, kokunun bileşiminde, apolar, polar veya aldehit veya ester karakterli moleküllerin olup olmadığını anlamamıza yardım eder.
Yine; bazı endemik bitkilerin AR GE çalışmaları, bilimsel makaleler, bitmiş ürünler ve yapay zeka destekli yeni bir koku reseptör ilişkisi modeli çıktılarımız arasında yer alacak.
Proje; Teknopark İstanbul’da yürütülen2. bakanlık projemiz olup 1. projemiz başarı ile tamamlanmıştır.
NAZ BİYOTEKNOLOJİ ANONİM ŞİRKETİ
SANAYİ MAH. TEKNOPARK BLV. TEKNOPARK 4A NO: 1 /4A
İÇ KAPI NO: 101
PENDİK/ İSTANBUL